Logiciel de comptabilité pour auto-entrepreneur : comment bien choisir

Comptabilité de l’auto-entrepreneur en 2026 : les règles essentielles

La comptabilité d’un auto-entrepreneur reste simple mais doit être rigoureuse pour rester conforme aux obligations légales et fiscales en 2026. Tenir ses documents correctement permet de prévenir les erreurs et de faciliter la gestion quotidienne.

Obligations comptables et documents obligatoires

Chaque auto-entrepreneur doit tenir un livre chronologique des recettes, précisant la date, le montant, le client et le mode de paiement. Les activités de vente de marchandises doivent également tenir un registre des achats afin de justifier les dépenses. Les factures, livres et pièces justificatives doivent être conservés au minimum 6 ans, selon l’art. L102 B du CGI (Code général des impôts).

Pour les activités relevant du Code de commerce, certains documents comptables doivent être conservés jusqu’à 10 ans, en version papier ou numérique, en application de l’article L123-22 du Code du Commerce.

Facturation en micro-entreprise : règles à respecter

Les factures et devis doivent comporter certaines informations. Cela inclut le nom, l’adresse, le SIRET, la date, la description de la prestation ou du produit, le montant HT et TTC, et la TVA si applicable. La numérotation des factures doit être chronologique et continue. Omettre ces mentions ou mal numéroter les documents expose à des sanctions fiscales.

TVA et compte bancaire : points de vigilance en 2026

Les auto-entrepreneurs doivent suivre attentivement les seuils de franchise de TVA : 85 000 € pour le commerce et 37 500 € pour les services. Au-delà, la TVA doit être facturée et déclarée. Un compte bancaire dédié est obligatoire si le CA dépasse 10 000 € pendant deux années consécutives.

Quelles fonctionnalités attendre d’un logiciel de compta pour auto-entrepreneur ?

Un logiciel comptable pour micro-entreprise doit proposer des fonctionnalités adaptées aux obligations légales et à la gestion quotidienne. 

Le socle indispensable pour être conforme

Le logiciel doit permettre de créer des devis et des factures conformes avec toutes les mentions obligatoires. Il doit aussi assurer le suivi des encaissements et l’automatisation du livre des recettes.

Les fonctions qui font réellement gagner du temps

Les fonctionnalités avancées incluent la synchronisation bancaire pour rapprocher automatiquement les transactions. Mais aussi la catégorisation automatique des revenus et des dépenses, et les relances de paiement. Des alertes sur le CA et la TVA préviennent tout dépassement des seuils légaux, pour simplifier la gestion fiscale.

Fonctions avancées selon l’activité

Selon l’activité, un logiciel de compta pour auto-entrepreneur peut proposer la gestion des achats, le suivi de projets ou de chantiers. Tout comme le multi-activités et les intégrations externes avec d’autres outils.